Línea 02

Efectos de temperatura y termodinámica estadística

Superficies de energía libre, poblaciones de Boltzmann y espectros IR y VCD dependientes de la temperatura para explicar la fluxionalidad y la quiralidad de clústeres.

  • energía libre
  • poblaciones de Boltzmann
  • espectroscopía IR
  • VCD
  • fluxionalidad
Gráfica de población relativa frente a temperatura, de 0 a 1500 K, para los isómeros del clúster Be6B11 negativo calculada con PBE0/Def2TZVP/GD3; el isómero 1 domina a baja temperatura y el 8 por encima de unos 800 K.
Poblaciones de Boltzmann de los isómeros de Be6B11− entre 0 y 1500 K. Fig. 4 de Buelna-Garcia et al., Materials (2020). CC BY 4.0

La mayoría de los cálculos describen las moléculas a 0 K, pero los experimentos se hacen a temperatura finita. A temperatura ambiente, un clúster puede ser una mezcla de isómeros cuya proporción cambia con la temperatura, y eso modifica lo que se observa en el laboratorio.

Esta línea construye superficies de energía libre a partir de la termodinámica estadística y calcula las poblaciones de Boltzmann de cada isómero en función de la temperatura. Con esas poblaciones se promedian los espectros infrarrojo (IR) y de dicroísmo circular vibracional (VCD) para compararlos directamente con los experimentos.

Preguntas que aborda

  • ¿A qué temperatura cambia la estructura dominante de un clúster?
  • ¿Cómo afecta la temperatura a la energía de enantiomerización de un clúster quiral?
  • ¿Qué isómeros explican un espectro experimental medido a una temperatura dada?

Se ha aplicado a sistemas como Au₁₀, Cu₁₃, Be₆B₁₁⁻ y Be₄B₈, y se complementa con dinámica molecular ab initio.

Publicaciones de esta línea

14 publicaciones

  • Francisco Eduardo Rojas-González, César Castillo-Quevedo, Peter Ludwig Rodríguez-Kessler, José Oscar Carlos Jimenez-Halla, Alejandro Vásquez-Espinal, Rajagopal Dashinamoorthy Eithiraj, Manuel Cortez-Valadez, José Luis Cabellos

    Exploration of Free Energy Surface of the Au10 Nanocluster at Finite Temperature

    Molecules 29(14), 3374 (2024)

  • Aned de Leon, José Luis Cabellos, César Castillo-Quevedo, Martha Fabiola Martín-del-Campo-Solís, Gerardo Martínez-Guajardo

    The Role of Nitrogen-Rich Moieties in the Selection of Arginine’s Tautomeric Form at Different Temperatures

    Acta Chimica Slovenica 70(4), 642–650 (2023)

  • Cesar Castillo-Quevedo, Carlos Emiliano Buelna-Garcia, Edgar Paredes-Sotelo, Eduardo Robles-Chaparro, Edgar Zamora-Gonzalez, Martha Fabiola Martin-del-Campo-Solis, Jesus Manuel Quiroz-Castillo, Teresa del-Castillo-Castro, Gerardo Martínez-Guajardo, Aned de-Leon-Flores, Manuel Cortez-Valadez, Filiberto Ortiz-Chi, Tulio Gaxiola, Santos Jesus Castillo, Alejandro Vásquez-Espinal, Sudip Pan, Jose Luis Cabellos

    Effects of Temperature on Enantiomerization Energy and Distribution of Isomers in the Chiral Cu13 Cluster

    Prime Archives in Material Science (2022)Capítulo

  • Martha Fabiola Martin-del-Campo-Solis, Edgar O. Zamora Gonzales, César Castillo-Quevedo, Emiliano Buelna-Garcia, Aned de León Flores, José Luis Cabellos

    Thermodynamic Properties of Cu38 Cluster

    Prime Archives in Chemistry (2022)Capítulo

  • Carlos Emiliano Buelna-García, Cesar Castillo-Quevedo, Jesus Manuel Quiroz-Castillo, Edgar Paredes-Sotelo, Manuel Cortez-Valadez, Martha Fabiola Martin-del-Campo-Solis, Tzarara López-Luke, Marycarmen Utrilla-Vázquez, Ana Maria Mendoza-Wilson, Peter L. Rodríguez-Kessler, Alejandro Vazquez-Espinal, Sudip Pan, Aned de Leon-Flores, Jhonny Robert Mis-May, Adán R. Rodríguez-Domínguez, Gerardo Martínez-Guajardo, Jose Luis Cabellos

    Relative Populations and IR Spectra of Cu38 Cluster at Finite Temperature Based on DFT and Statistical Thermodynamics Calculations

    Frontiers in Chemistry 10, 841964 (2022)

  • Carlos Emilano Buelna-Garcia, Cesar Castillo-Quevedo, Edgar Paredes-Sotelo, Gerardo Martinez-Guajardo, Jose Luis Cabellos

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    Density Functional Theory – Recent Advances, New Perspectives and Applications (IntechOpen) (2022)Capítulo

  • Cesar Castillo-Quevedo, Carlos Emiliano Buelna-Garcia, Edgar Paredes-Sotelo, Eduardo Robles-Chaparro, Edgar Zamora-Gonzalez, Martha Fabiola Martin-del-Campo-Solis, Jesus Manuel Quiroz-Castillo, Teresa del-Castillo-Castro, Gerardo Martínez-Guajardo, Aned de-Leon-Flores, Manuel Cortez-Valadez, Filiberto Ortiz-Chi, Tulio Gaxiola, Santos Jesus Castillo, Alejandro Vásquez-Espinal, Sudip Pan, Jose Luis Cabellos

    Effects of Temperature on Enantiomerization Energy and Distribution of Isomers in the Chiral Cu13 Cluster

    Molecules 26(18), 5710 (2021)

  • Carlos Emiliano Buelna-Garcia, Cesar Castillo-Quevedo, Jesus Manuel Quiroz-Castillo, Gerardo Martinez-Guajardo, Aned de-Leon-Flores, Gilberto Anzueto-Sanchez, Martha Fabiola Martin-del-Campo-Solis, Jose Luis Cabellos

    Effects of Temperature on IR Spectroscopy of the Fluxional Be6B11− Cluster

    Prime Archives in Material Science (2021)Capítulo

  • Carlos Emiliano Buelna-García, Eduardo Robles-Chaparro, Tristan Parra-Arellano, Jesus Manuel Quiroz-Castillo, Teresa del-Castillo-Castro, Gerardo Martínez-Guajardo, Cesar Castillo-Quevedo, Aned de-León-Flores, Gilberto Anzueto-Sánchez, Martha Fabiola Martin-del-Campo-Solis, Ana Maria Mendoza-Wilson, Alejandro Vásquez-Espinal, Jose Luis Cabellos

    Theoretical Prediction of Structures, Vibrational Circular Dichroism, and Infrared Spectra of Chiral Be4B8 Cluster at Different Temperatures

    Molecules 26(13), 3953 (2021)

  • Analila Luna-Valenzuela, José Luis Cabellos, Alvaro Posada-Amarillas

    Effect of temperature on the structure of Pd8 and Pd7Au1 clusters: an ab initio molecular dynamics approach

    Theoretical Chemistry Accounts 140(7) (2021)

  • Martha Fabiola Martin-del-Campo-Solis, Cesar Castillo-Quevedo, Edgar Zamora-Gonzalez, Carlos Emiliano Buelna-García, Eduardo Robles-Chaparro, Gerardo Martínez-Guajardo, Aned de-Leon-Flores, Gilberto Anzueto-Sánchez, Jose Luis Cabellos

    Exploration of Free Energy Surface of Chiral Be4B8 Cluster at Different Temperatures

    Prime Archives in Material Science (2021)Capítulo

  • Carlos Emiliano Buelna-Garcia, José Luis Cabellos, Jesus Manuel Quiroz-Castillo, Gerardo Martinez-Guajardo, Cesar Castillo-Quevedo, Aned de-Leon-Flores, Gilberto Anzueto-Sanchez, Martha Fabiola Martin-del-Campo-Solis

    Exploration of Free Energy Surface and Thermal Effects on Relative Population and Infrared Spectrum of the Be6B11− Fluxional Cluster

    Materials 14(1), 112 (2020)

  • Said Jalife, Lei Liu, Sudip Pan, José Luis Cabellos, Edison Osorio, Cheng Lu, Thomas Heine, Kelling J. Donald, Gabriel Merino

    Dynamical behavior of boron clusters

    Nanoscale 8(40), 17639–17644 (2016)

  • Gerardo Martínez-Guajardo, José Luis Cabellos, Andres Díaz-Celaya, Sudip Pan, Rafael Islas, Pratim K. Chattaraj, Thomas Heine, Gabriel Merino

    Dynamical behavior of Borospherene: A Nanobubble

    Scientific Reports 5, 11287 (2015)

Otras líneas

  • Predicción estructural de clústeres

    Búsqueda del mínimo global en superficies de energía potencial de clústeres atómicos y moleculares mediante algoritmos evolutivos acoplados a la teoría del funcional de la densidad.

  • Enlace químico y aromaticidad

    Diseño y análisis de especies con enlaces no convencionales, como carbonos planos hipercoordinados, estrellas moleculares y motivos tubulares de boro.